O projeto PROPRATA e os projetos agregados operam no sentido de buscar evidências que possibilitem a reconstituição do povoamento da região platina oriental. Isto requer um estudo sincrônico e diacrônico das sociedades encontradas nesta área em suas adaptações ambientais, inovações tecnoeconômicas, formas de organização sociopolíticas, suas manifestações culturais e os valores ideológicos que as caracterizaram ao longo do tempo.
Este trabalho exige a colaboração estreita entre ciências humanas - arqueologia, história, antropologia - e ciências da natureza que se preocupam com as mudanças ocorridas no tempo e no espaço. Esta interação não é nada simples, pois estas ciências, embora muitas vezes abordem os mesmos objetos e se deparem com problemas similares, diferem bastante com relação aos recursos técnicos que utilizam na pesquisa, metodologias e orientações teóricas.
Parte do trabalho do projeto PROPRATA inclui justamente ampliar o diálogo entre estas áreas, através da colaboração entre pesquisadores de diferentes formações e do treinamento de novos pesquisadores conscientes dos limites e possibilidades da investigação interdisciplinar.